Kini bentuk fisik dan ornamen Masjid Agung Al-Jihad Ciputat berbeda jauh dengan penampakan aslinya saat awal berdiri. Perkembangan zaman, membuat masjid itu didesain kebih modern.
Terdapat kutipan kalam suci Al-Quran di tiang penyangga, di pangkal kubah, serta di bagian dinding masjid. Lalu di sekitar area mimbar sengaja dibuat menyerupai penampakan ka'bah dengan warna dinding hitam.
"Dinding depan itu warna hitam, jadi dibuat menyerupai bentuk ka'bah," katanya.