Untuk mengantisipasi lonjakan pengguna, KAI Commuter mengoptimalkan berbagai fasilitas pelayanan di Stasiun BNI City. Gate elektronik dan loket di hall baru sisi timur yang mengarah ke Jalan Sudirman serta sisi barat menuju Stasiun Karet lama telah dioperasikan.
Selain itu, selasar sisi selatan yang menjadi akses pedestrian juga telah dilengkapi penerangan dan petugas pengamanan.
KAI Commuter turut menyediakan layanan bagi pengguna prioritas, seperti lansia, ibu hamil, dan penyandang disabilitas, termasuk fasilitas kursi roda. Pengguna prioritas dapat menghubungi petugas yang berjaga di selasar akses masuk stasiun untuk mendapatkan layanan tersebut.
Bagi pengguna yang akan menuju Stasiun Manggarai, KAI Commuter telah mengoperasikan hall baru sisi timur riverside dari arah Jalan Sudirman. Pengguna dapat langsung menuju peron Jalur 2 untuk menggunakan Commuter Line tujuan Stasiun Manggarai.
Sementara itu, pada jalur pedestrian dari arah Stasiun Karet, KAI Commuter akan menambah tenda atau kanopi untuk melindungi pengguna dari panas dan hujan.