Anwar juga menekankan, keutuhan sebagai umat Islam harus senantiasa dijaga.
"Oleh karena itu, penting untuk saling memahami dan saling menghormati. Bahkan kalau perlu kita, sebagai bangsa yang demokratis ini, perlu membiasakan diri untuk berbeda. Asal jangan soal prinsipil saja. Asal jangan soal akidah saja. Asal jangan soal qath'i saja," ujarnya.
Menurut dia, perbedaan ini justru menjadi bagian dari dinamika yang memperkaya khazanah ilmu pengetahuan. Perbedaan yang dikelola dengan baik, kata dia, akan menjadi sebuah harmoni yang indah.