Hingga Rabu malam (9/7/2025), dari total 65 orang di kapal, 42 orang telah ditemukan terdiri atas 30 selamat dan 12 meninggal dunia. Sisanya 25 orang masih dalam pencarian.
Dua jenazah tambahan ditemukan pada Rabu pagi di pesisir Pebuahan, Desa Banyu Biru, Kecamatan Negara, Kabupaten Jembrana, Bali.
Operasi SAR gabungan terus dilakukan dengan melibatkan lebih dari 1.000 personel dari unsur laut, darat, dan udara. Penyisiran dilakukan dari perairan Tanjungwangi, Banyuwangi, hingga ke selatan pesisir Jembrana, Bali, sejauh lebih dari 60 kilometer dari Pelabuhan Gilimanuk.
Sebelumnya, KMP Tunu Pratama Jaya dilaporkan mengalami kebocoran dan blackout pada Kamis dini hari (3/7/2025). Saat itu kapal membawa 53 penumpang dan 12 kru, serta 22 kendaraan berbagai jenis. Hingga kini, pencarian masih dilakukan intensif setiap hari mulai pukul 07.00 hingga 19.00 WIB dengan mempertimbangkan kondisi cuaca Selat Bali yang dinamis.