Terdapat tiga pilar penting terkait pendirian UIII. Pertama, UIII sebagai lembaga pendidikan dan riset. Kedua, UIII sebagai pusat kebudayaan Islam dan kemasyarakatan. Dan ketiga, UIII sebagai pusat penelitian tentang isu keislaman strategis dan tantangan dunia Islam.
Pada saat awal, UIII ini akan membuka program syariah, aqidah, tafsir, hadits, tasawuf, usul fiqh, lughah, dan balaghah. Terdapat pula ilmu-ilmu sosial, teknologi halal, seni, dan musik.
Menurut Kamaruddin, pihaknya ingin mengombinasikan tradisi kesarjanaan di Arab dan barat. "Jadi UIII nanti tidak akan sepenuhnya seperti di Arab dan tidak pula seperti Barat, tetapi kita mempelajari model keduanya untuk mencari bentuk baru yang lebih sesuai dengan Indonesia," ucap dia.
Dalam pertemuan ini, para akademisi Islam dunia yang hadir antara lain Wakil Rektor Universitas Al-Azhar Mesir Mohamed Abouzaid Alamair, Wakil Rektor Universitas Qurawiyyin Maroko Mohamed Adiouane, akademisi Australian National University Centre for Arab and Islamic Studies James Piscatori, akademisi McGill University Philip Buckley dan Moncef ben Abdeljelill dari Sousse University, Tunisia.
Sementara itu James Piscatori mengungkapkan, tantangan dunia Islam saat ini adalah banyaknya analisis objektif yang sebenarnya telah bias oleh budaya suatu bangsa. "Dalam banyak kasus di dunia, interpretasi berdasarkan latar belakang akan selalu terlibat," katanya.
Karena itu, institusi yang menjadi pusat dari riset keilmuan dan budaya akan sangat dibutuhkan untuk memecahkan salah satu persoalan pokok di dunia Islam.