Tidak lama, Agus pun diangkat menjadi Komandan Paspampres pada 2020–2021.
Agus kini dilantik menjadi Panglima TNI menggantikan Laksamana Yudo Margono. Arahan Jokowi Agus harus berkolaborasi dengan Polri dan seluruh elemen masyarakat.
"Jadi setelah waktu itu saya menghadap beliau, arahannya ya itu. Melaksanakan tugas pokok, berkolaborasi dengan Polri dan seluruh elemen masyarakat," kata Agus di Istana Negara, Jakarta, Rabu (22/11/2023).
Agus menjelaskan kolaborasi tersebut untuk menangani permasalahan di Papua, hingga bencana alam. Dia menekankan akan selalu berkolaborasi dengan semua pihak.
"Tentang penanganan Papua, tentang bencana alam yang sering terjadi disini. Jadi kita selalu kolaborasi dengan kementerian terkait. Itu yang disampaikan bapak presiden. Kita menggandeng semua," kata Agus.