Eko Margiyono merupakan lulusan Akademi Militer 1989 dari kecabangan infanteri. Karier prajurit kelahiran 12 Mei 1967 ini termasuk cemerlang.
Sejumlah jabatan strategis pernah dipegangnya. Sinar terang Eko mulai tampak ketika dia dipercaya sebagai Komandan Grup A Paspampres.
Untuk diketahui, Grup A Paspampres bertugas melaksanakan pengamanan fisik langsung jarak dekat setiap saat terhadap presiden beserta keluarganya dan berkekuatan empat detasemen. Sejumlah tokoh militer Indonesia pernah berkarier di posisi ini, sebut saja Subagyo HS (kelak menjadi KSAD), Sjafrie Sjamsoeddin, hingga Doni Monardo.
Karier Eko terus melesat. Dari Paspampres dia dipromosikan sebagai Danrem 061/Surya Kencana (2014-2015).
Pangkat Bintang Satu diraihnya saat dipercaya sebagai Komandan Korem (Danrem) 033/Wira Pratama Kodam I/Bukit Barisan (2014-2015). Eko Margiyono selanjutnya dipercaya menduduki jabatan Wakil Asisten Operasi (Waasops) Kepala Staf TNI AD (2015-2017), kemudian menjabat Kepala Staf Kodam (Kasdam) Jaya (2017).