Selanjutnya pada 2006, Kiagus kembali ke Kementerian Keuangan dengan menjabat sebagai Direktur Sistem Perbendaharaan di Direktorat Jenderal Perbendaharaan. Selanjutnya, ia dipercaya menduduki jabatan Direktur Pelaksanaan Anggaran sejak 2008 hingga 2009, di Direktorat Jenderal Perbendaharaan.
Kiagus kemudian diangkat sebagai Sekretaris Direktorat Jenderal Perbendaharaan pada 2009. Kemudian pada Januari 2011 menjabat sebagai Staf Ahli Bidang Pengeluaran Negara hingga ditugaskan sebagai Pelaksana Tugas (Plt.) Sekretaris Jenderal Kementerian Keuangan pada bulan September 2011.
Pada 13 Januari 2012, Kiagus ditetapkan sebagai Sekretaris Jenderal Kementerian Keuangan, kemudian pada 1 Juli 2015 dilantik menjadi Inspektur Jenderal Kementerian Keuangan.
Profil Kiagus Ahmad Badaruddin
Lahir: Palembang, 29 Maret 1957
Wafat: 14 Maret 2020
Jabatan: Kepala PPATK
Pendidikan:
S1 Ekonomi Manajemen Universitas Sriwijaya Palembang, 1986.
S2 University of Illinois, 1991.
Karier:
Komisaris di PT Perusahaan Gas Negara.
Komisaris di Bank Negara Indonesia.
Kementerian Keuangan.
KPK.
Penghargaan:
Satyalancana Karya Satya 30 Tahun