Nama Nawawi mulai dikenal saat bertugas di PN Jakarta Pusat periode 2011-2013 lalu menjabat sebagai Ketua PN Jakarta Timur pada tahun 2016. Hingga akhir 2017, dia dipromosikan sebagai hakim tinggi di Pengadilan Tinggi Denpasar.
Pada 20 Desember 2019, Nawawi beserta 4 Komisioner KPK dilantik Presiden Jokowi dan menjabat Wakil Ketua KPK periode 2019-2023.
Saat Nawawi bertugas sebagai hakim di PN Jakarta Pusat, dia dikenal sebagai hakim dengan spesialisasi mengadili kasus tindak pidana korupsi yang dilimpahkan oleh KPK. Bahkan, ketika Nawawi menjabat Ketua PN Jakarta Timur, dia diperbantukan sebagai hakim Pengadilan Tipikor Jakarta.
Nama Nawawi mencuat setelah memutus kasus suap yang melibatkan mantan hakim Mahkamah Konstitusi (MK) Patrialis Akbar terkait uji materi UU Peternakan dan Kesehatan Hewan.
Nawawi juga menjadi salah satu hakim yang memutus kasus suap dengan terpidana mantan Ketua DPD Irman Gusman terkait suap kuota gula impor.