Pada masa pemerintahan orde baru, pasukan Cakrabirawa tercoreng karena aksi penculikan Jenderal Pahlawan Revolusi yang dimotori oleh Letkol Untung dan Lettu Dul Arif pada masa G30S/PKI. Kejadian ini melibatkan 60-an orang pasukan Cakrabirawa atau sekitar 2 persen dari total pasukan.
Hal ini menyebabkan Cakrabirawa dibubarkan pada 28 Maret 1966 atas dasar Surat Perintah II Maret 1966 atau biasa disebut dengan Supersemar.
Tanggung jawab untuk menjaga keselamatan presiden selanjutnya diserahkan ke Polisi Militer Angkatan Darat atau Satgas Pomad. Selanjutnya pada masa pemerintahan Soeharto, Satgas Pomad diganti dengan Paspampres.