Pada 2014 dia menikahi Franka Franklin dan dikarunia anak bernama Solara Franklin Makarim.
Pendidikannya lebih banyak diselesaikan di luar negeri. Mulai dari SMA di Singapura dan melanjutkan ke perguruan tinggi di Harvard University, Amerika Serkat jurusan International Relations di Brown University. Dia juga pernah menempuh studi di Harvard Business School dan lulus dengan menyandang gelar MBA (Master Business Of Administration).
Berkat kerja keras dan keuletan menjadikan dia sebagai salah satu pengusaha muda yang berhasil. Majalah Globe Asia 2018 pernah mencatat total kekayaan Naidem Makarim mencapai 100 juta dolar Amerika atau setara Rp1,4 triliun. Kekayaan itu diraup dari saham dimiliki di Gojek.