Namun, seluruh terdakwa dalam perkara tersebut dinyatakan bebas karena tidak terbukti secara sah dan meyakinkan melakukan pelanggaran HAM berat.
Sementara itu, 13 perkara lainnya belum memasuki tahap persidangan. Kasus-kasus tersebut masih dalam proses penyelidikan Komnas HAM sebelum berkasnya diserahkan kepada Kejaksaan Agung untuk ditindaklanjuti.
Adapun 13 kasus tersebut meliputi Peristiwa 1965-1966 yang penyelidikannya telah berlangsung sejak 2012, Penembakan Misterius (Petrus), Talangsari, Rumoh Geudong, dan Pos Sattis di Aceh.
Selain itu, terdapat kasus Penghilangan Orang Secara Paksa 1997-1998, Kerusuhan Mei 1998, Trisakti, Semanggi I dan Semanggi II, Pembunuhan Dukun Santet 1998-1999, Simpang KKA, Wasior 2001, Jambu Keupok di Aceh, serta Peristiwa Wamena.
Yusril menilai belum tuntasnya penanganan perkara tersebut dipengaruhi perbedaan pandangan mengenai kriteria suatu peristiwa dapat dikategorikan sebagai pelanggaran HAM berat. Kendala lainnya adalah proses penyelidikan dan penyidikan yang ditangani dua institusi berbeda sehingga koordinasi penanganan perkara tidak mudah.