Tekanan hasil pembakaran memberikan daya dorong ke depan hingga dapat mengeluarkan roket. Namun di balik mekanisme yang sederhana, Scramjet membutuhkan desain dan perhitungan yang sangat kompleks.
Selain itu, panas di dalam Scramjet yang mencapai 1600 derajat celcius membuat mesin ini memerlukan material khusus untuk menahan suhu tinggi.
Tantangan pengembangan mesin Scramjet menjadi lebih sulit lagi karena tidak adanya terowongan angin yang mampu mengalirkan udara dengan kecepatan hipersonik, sehingga pengujian mesin Scramjet harus dilakukan di lapangan dengan pendorong roket atau menggunakan hypersonik chamber test yang sangat mahal.
Karena beberapa hal yang telah disebutkan, tak heran jika harga mesin ini begitu mahal, sehingga hanya segelintir negara yang memilikinya.