Jenazah Gus Alam dimakamkan di kompleks Pondok Pesantren Al-Fadlu 2, dekat makam ayahnya, KH Dimyati Rois. Ia meninggalkan seorang istri, seorang putri, dan satu anak yang masih dalam kandungan.
Jadi, Gus Alam berasal dari Pondok Pesantren Al-Fadlu Wal Fadhilah dan Al-Fadlu 2 di Kendal, Jawa Tengah. Ia dikenal sebagai ulama muda, politisi PKB empat periode, dan sosok yang sangat aktif di dunia pesantren serta parlemen nasional. Kepergian Gus Alam akibat kecelakaan menjadi duka mendalam bagi dunia pesantren, politik, dan masyarakat luas.