Untuk Commuter Line Prameks Yogyakarta-Kutoarjo dari yang sebelumnya pukul 06.30 WIB, menjadi pukul 06:37 WIB. Sedangkan dari Kutoarjo-Yogyakarta yang sebelumnya pukul 05.15 WIB menjadi pukul 05.25 WIB.
Sementara untuk keberangkatan terakhir Yogyakarta-Palur, sebelumnya pukul 22.35 WIB menjadi 17.45 WIB pada weekday, dan 20.16 WIB pada weekend. Sedangkan Palur-Yogyakarta sebelumnya pukul 21.05 WIB menjadi 18.07 WIB.
Untuk Commuter Line Prameks Yogyakarta-Kutoarjo dari yang sebelumnya pukul 17.35 WIB, menjadi pukul 18.38 WIB dan untuk Kutoarjo-Yogyakarta dari yang sebelumnya pukul 15.58 WIB menjadi pukul 16.05 WIB.
Anne Purba menyebut, perjalanan Commuter Line Yogya-Solo dan Commuter Line Prameks pada Gapeka 2023 yang biasanya terdapat penyusulan kereta jarak jauh, akan ada pengurangan penyusulan. Untuk Commuter Line Yogya-Solo yang sebelumnya 7 Commuter Line menjadi hanya 2 Commuter Line saja. Sedangkan Commuter Line Prameks tidak ada perubahan, 2 Commuter Line yang akan disusul.
KAI Commuter mencatat untuk volume pengguna Commuter Line Yogya-Solo sampai dengan Mei telah melayani pengguna sebanyak 2.136.265 orang. Sedangkan Commuter Line Prameks di bulan yang sama telah mengangkut pengguna 331.186 orang.