Pengetatan kontrol kualitas (quality control) wajib dilakukan mulai dari tahap penerimaan bahan baku, pembersihan sayuran, hingga penyajian makanan sebelum didistribusikan ke sekolah-sekolah.
Pemerintah Daerah mengimbau pihak sekolah dan orang tua murid untuk tetap aktif melaporkan apabila menemukan ketidaksesuaian standar kebersihan maupun gizi pada program Makan Bergizi Gratis di wilayah Pati.