Tokoh NU KH Mustofa Bisri atau Gus Mus juga menyampaikan rasa belasungkawa atas kepergian sahabatnya tersebut. Pengasuh Pondok Pesantren Raudlatut Thalibin ini mengunggah foto kenangan bersama Agus Sunyoto dan budayawan Sujiwo Tedjo.
“Sejarawan penulis buku "Atlas Wali Songo" yang tekun memberi pencerahan melalui tulisan maupun ceramah, termasuk dalam meluruskan sejarah-itu adalah seorang alim yang tawaduk dan ikhlas. Aku yakin beliau husnul khãtimah. InsyãAlläh. AskanahuLlãhu fasiiha jannatiH. Al- Fãtihah,” ucapnya.
Dikutip dari laman resmi NU, Agus Sunyoto lahir di Surabaya, 21 Agustus 1959. Dia termasuk budayawan yang produktif menulis. Salah satu karya fenomenalnya yaitu buku Atlas Wali Songo yang mengisahkan penyebaran agama Islam di Nusantara.
Dia meyakinkan publik bahwa Wali Songo merupakan fakta sejarah, bukan sekadar dongeng. Karya-karya lainnya yang bisa dibaca khalayak antara lain Resolusi Jihad, Banser Berjihad Melawan PKI, Sunan Ampel: Taktik dan Strategi Dakwah Islam di Jawa, dan Suluk Abdul Jalil: Perjalanan Ruhani Syeh Siti Jenar.