4. Kupang
Kupang merupakan kota terbesar di kepulauan Timor yang terletak di pesisir Teluk Kupang bagian barat laut Pulau Timor. Pada Indeks Kota Toleransi 2020, Kota Kupang mendapatkan skor 6,037.
Pemerintah Kupang memberikan perhatian penuh terkait upaya pembangunan Kota Kupang menjadi Kota Kasih, yakni rumah persaudaraan bagi semua umat beragama.
Diketahui, penduduk Kota Kupang terdiri atas berbagai suku yang mayoritas berasal dari etnis Tionghoa, Suku Sabu, Rote, Flores, dan Timor. Tak sedikit juga orang Jawa dan Bali yang memilih tinggal di sana.
5. Salatiga
Salatiga merupakan kota kecil di provinsi Jawa Tengah yang mempunyai luas wilayah kurang lebih 54,98 km persegi. Berpenduduk sekitar 196.082 jiwa, kota ini dinobatkan sebagai kota yang memiliki toleransi tinggi.
Setara Institute memberikan skor Indeks Kota Toleransi (IKT) 2020 sebesar 6,717. Sebelumnya, pada tahun 2015, 2016, dan 2018 Setara Institute juga menempatkan Salatiga di posisi 10 besar kota paling toleran di Indonesia.