Onde-onde masuk ke Indonesia pada 1300 - 1500 M, dibawa oleh Laksamana Cheng Ho dari Dinasti Ming. Bagi masyarakat China onde-onde ini merupakan salah satu makanan wajib yang dimakan pada saat perayaan cap go meh, yaitu pada hari ke-15 setelah perayaan Tahun Baru China.
Masyarakat China percaya jika memakan onde-onde akan membawa keberuntungan serta harapan yang lebih baik lagi untuk ke depannya.
Sebelum masuk ke nusantara, mulanya onde-onde ini berisi gula merah yang dijadikan pasta. Setelah masuk nusantara, onde-onde mulai dimodifikasi isiannya oleh masyarakat Indonesia yang mulanya berisi pasta gula merah menjadi kacang hijau.
Walaupun isi di dalamnya tidak sama seperti pada masa sebelum masuk nusantara, onde-onde menjadi makanan favorit masyarakat Indonesia karena rasanya yang sedikit gurih dan cocok untuk lidah masyarakat Indonesia.
Onde-onde dianggap sebagai makanan pembawa keselamatan dan kebersamaan. Selain dianggap sebagai pembawa keselamatan dan kebersamaan. Setelah masuk ke Indonesia, onde-onde dikenal dengan makanan khas Mojokerto.