Memasuki sesi Q2, Pedro Acosta memulai dengan catatan waktu 1 menit 29,298 detik, memimpin sementara diikuti oleh Raul Fernandez dan Franco Morbidelli. Namun, menjelang lima menit terakhir, Alex Marquez berhasil mengambil alih posisi teratas dengan 1 menit 28,967 detik.
Tapi drama belum berakhir. Marco Bezzecchi tampil luar biasa di penghujung sesi, mencatatkan waktu 1 menit 28,809 detik dan merebut pole position. Alex Marquez harus puas di posisi kedua, sementara Fabio Di Giannantonio melengkapi posisi tiga besar.
Sayangnya, Francesco Bagnaia mengalami nasib buruk dan harus memulai balapan dari posisi ke-16 setelah masalah teknis di Q1.
Hasil Kualifikasi MotoGP Valencia 2025 – Papan Atas:
Marco Bezzecchi – 1:28,809
Alex Marquez – 1:28,967
Fabio Di Giannantonio – 1:29,043