Begitu babak kedua dimulai, ritme permainan tak banyak berubah. Namun, Basel tampak berusaha memberikan perlawanan yang lebih besar, ketimbang pada paruh pertama.
Basel mendapat peluang pada menit ke-66. Arthur Cabral mencoba peruntungannya dengan melepaskan tembakan dari luar kotak penalti. Tetapi, upayanya bisa dihentikan kiper Shakhtar Andriy Pyatov.
Sibuk menyerang, pertahanan Basel justru lengah. Shakhtar mendapat penalti pada menit ke-75, usai Taison dijatuhkan di kotak terlarang. Alan Patrick yang menjadi eksekutor sukses menjalankan tugasnya.
Belum puas, Shakhtar kemudian kembali mencetak gol pada menit ke-88. Domilson Cordeiro dos Santos berhasil merobek gawang Basel, usai mendapat umpan dari Tete dan melepaskan tembakan mendatar.
Memasuki masa injury time, baru akhirnya Basel mendapat gol melalui Ricky von Wolfswinkel melalui tandukannya. Gol itu sekaligus menjadi akhir pertandingan.