Memasuki babak kedua, Borneo FC meningkatkan intensitas permainan. Pesut Etam lebih sering menekan pertahanan Madura United dan beberapa kali menciptakan peluang meski belum ada yang berujung gol hingga pertengahan babak kedua.
Madura United mencoba keluar dari tekanan dengan sesekali melancarkan serangan balik. Namun, rapatnya lini belakang Borneo FC membuat laga tetap berjalan buntu dan duel Borneo FC vs Madura United terlihat akan berakhir tanpa pemenang.
Kebuntuan akhirnya pecah pada menit ke-88. Douglas Coutinho mencatatkan namanya di papan skor dan membawa Borneo FC unggul 1-0. Gol telat tersebut menjadi pembeda di laga Borneo FC vs Madura United setelah sebelumnya kedua tim sama-sama kesulitan memaksimalkan peluang.
Di sisa waktu, Madura United berupaya menyamakan kedudukan, tetapi Borneo FC mampu menjaga disiplin pertahanan hingga peluit panjang dibunyikan. Skor 1-0 untuk tuan rumah tidak berubah, memastikan Pesut Etam mengamankan tiga poin dan melanjutkan rekor 11 kemenangan beruntun di Super League 2025-2026.
Borneo FC (4-3-3)
Nadeo Argawinata; Muhammad Fajar Fathurrahman, Komang Teguh Trisnanda, Christophe Nduwarugira, Westherley Garcia Nogueira; Caxambu, Kei Hirose, Rivaldo Enero Pakpahan, Juan Felipe Villa; Douglas Coutinho, Mariano Peralta, Joel Vinicius.
Pelatih: Fabio Araujo Lefundes.
Madura United (4-3-3)
Moch Diky Indriyani; Nur Diansyah, Pedro Monteiro, Jorge Mendonça, Roger Bonet Badia; Kerim Palic, Jordy Wehrmann, Paulo Sitanggang; Ahmad Rusadi, Aji Kusuma, Balotelli.
Pelatih: Alfredo Vera