Junaidi juga sempat mengantar Timnas Indonesia juara Piala Merdeka 1969 di Malaysia. Catatan impresifnya membuat Junaidi menjadi bagian dari pelatihan nasional jangka panjang arahan pelatih Wiel Coerver.
Di sana, Junaidi sempat mencicipi rasanya bertanding melawan tim-tim Eropa seperti Ajax Amsterdam, dan Manchester United. Performanya yang konsisten membuat Junaidi sempat ditawari masuk klub Belanda Go Ahead Eagles.
Tawaran itu, kabarnya, disampaikan langsung oleh Wiel Coerver. Namun, Junaidi tak kunjung hijrah ke Eropa karena berbagai alasan. Dia tetap bersinar bersama klub lokal seperti Persija Jakarta dan Persebaya Surabaya.