Lisa dibundel dengan sistem operasi dan "office suite" dari tujuh aplikasi: LisaWrite, pengolah kata; LisaCalc, sebuah spreadsheet; LisaDraw, program menggambar vektor; LisaList, database primitif; LisaProject, aplikasi manajemen proyek; LisaTerminal, emulator terminal yang bekerja dengan modem; dan LisaGraph, program pembuat bagan.
Sistem operasi (Lisa OS) memiliki preemptive multitasking dan dapat menjalankan banyak program sekaligus. Perangkat juga mendukung memori virtual dan perlindungan memori. Untuk mendapatkan fitur ini diperlukan chip Memory Management Unit (MMU), tapi Motorola belum membuatnya, jadi Apple harus merancang solusinya sendiri.
Semua perangkat keras dan perangkat lunak revolusioner ini luar biasa, tetapi harganya mahal. Harga Lisa mencapai 9.995 dolar AS, yang berarti hampir 30.000 dolar AS hari ini. Ini terlalu banyak untuk pengguna rumahan, sebagaimana dikutip dari Ars Technica.
Pemilik bisnis—target pasar untuk Lisa—mungkin membayar sebanyak ini, tapi mereka mengharapkan komputer untuk mendukung banyak pengguna yang terhubung melalui terminal berbasis teks murah dan untuk menjalankan perangkat lunak akuntansi yang membosankan, bukan aplikasi desain esoterik untuk seniman grafis pemula.
Akibatnya, penjualan Lisa melambat. Hanya beberapa ribu komputer yang terjual pada tahun pertama, dan jumlahnya tidak bertambah banyak setelah itu. Mereka tidak terbantu oleh Jobs yang berlarian memberitahu semua orang bahwa komputer revolusioner sesungguhnya dari Apple, Macintosh, sudah dekat.