Pada awal 1990-an, Tanty sempat terkena penyakit kanker dan nyaris meninggal dunia. Namun, dengan ketekunan berobat dan keyakinan, dia sembuh dari penyakit tersebut.
Kemudian pada tanggal 22 November 1998, Tanty Yosepha meninggal dunia di RS Pertamina Jakarta karena serangan jantung. Jenazah Tanty Yosepha lalu dimakamkan di makam keluarga di Kranggotan, Imogiri, Bantul, berdekatan dengan makam ibundanya.
Dia meninggalkan seorang suami yakni Enteng Tanamal serta dua orang anak bernama Yoan Tanamal dan Vitae Tanamal. Anak pertamanya, Yoan, terkenal sebagai penyanyi cilik dan aktris film serta sinetron.