Untuk hulu ledak, B61-12 menggunakan bom yang sama dengan B61-4 dengan dua rakitan utama, yakni rakitan bom serta pemandu tail kit. Perakitan bom terdiri dari komponen nuklir dan non-nuklir yang diperbaharui sedangkan pemandu tail kit menggabungkan kemampuan terjun bebas terpandu dengan kemampuan pengiriman balistik dari versi B61.
Dilengkapi empat sirip pada bagian ekor, senjata ini menawarkan tingkat akurasi tinggi serta kemampuan stand-off terbatas dibandingkan versi sebelumnya.
Selain itu senjata taktis ini membawa hulu ludak nuklir lebih rendah dengan tujuan menghancurkan target militer dengan dampak kerusakan minimum. Hulu ledaknya ada empat pilihan, yaitu 0,3 kiloton (kt), 1,5 kt, 10 kt, serta 50 kt.
Saat beroperasi, B61-12 menggunakan sistem navigasi inersia (INS) untuk mencapai probabilitas tinggi. Tingkat akurasi B61-12 sekitar 30 sentimeter.
Pada Juni 2020, B61-12 sukses menjalani uji terbang menggunakan jet tempur F-15E Angkatan Udara AS. Bom tersebut dijatuhkan dari ketinggian 25.000 kaki serta berada di udara selama kurang lebih 55 detik sebelum mengenai sasaran.