Setelah itu, tepatnya pada 2008 Anwar kembali aktif berpolitik. Bersamaan dengan itu Anwar kembali didakwa atas tuduhan sodomi. Dia bebas dari penjara pada Januari 2012 juga dengan alasan kurang bukti.
Namun dia hanya menghirup udara bebas selama 2 tahun sebelum kembali masuk penjara. Pengadilan membatalkan pembebasannya untuk kasus sebelum itu.
Anwar bebas dari penjara setelah mendapat pengampunan dari raja pada 2018 usai pemilu. Saat itu kondisi berubah drastis, Anwar dan Mahathir bersatu untuk mengalahkan dominasi UMNO dengan koalisi Barisan Nasionalnya. Saat itu Malaysia dipimpin PM Najib Razak.
Pembebasan Anwar tak lepas dari peran Mahathir yang melobi Raja Malaysia agar memberikan pengampunan. Anwar akhirnya bebas dari penjara dan kembali ke pemerintahan memimpin koalisi Pakatan Harapan.
Namun pemerintahan Pakatan Harapan hanya berusia 2 tahun atau sampai Februari 2020. Mahathir secara tidak terduga mengundurkan diri memicu kekacauan politik yang belum pernah terjadi sebelumnya. Setelah itu kepemimpinan Malaysia beralih ke Perdana Menteri Muhyiddin Yassin.