Anne mengakui bahwa terdapat tujuh perjalanan commuterline yang terganggu imbas perbaikan kereta bandara tersebut. Adapun, tujuh perjalanan yang turut terganggu sebagai berikut:
1. Commterline No.5162C relasi Kampungbandan-Manggarai tertahan di sinyal masuk Stasiun Manggarai;
2. Commuterline No.5067B relasi Bekasi-Angke perjalanannya tertahan di lintas Manggarai-Sudirman.
3. Commuterline No.5065B relasi Cikarang-Angke perjalananya tertahan di Jalur VII Stasiun Manggarai.
4. Commuterline No.5123B relasi Cikarang-Kampungbandan perjalananya tertahan di Jalur II Stasiun Jatinegara.
5. Commuterline No.5093D relasi Bekasi-Manggarai perjalananya tertahan di Jalur III Stasiun Jatinegara.
6. Commuterline No.5559B relasi Cikarang-Kampungbandan perjalananya tertahan di Jalur IV Stasiun Jatinegara.
7. Commuterline No.13915 relasi Cikarang-Manggarai perjalananya tertahan di Jalur III Stasiun Cakung
Diketahui sebelumnya, kereta api bandara 916A mengalami gangguan di Stasiun Manggarai, pada malam hari ini. Akibatnya, PT KAI memadamkan sementara Listrik Aliran Atas (LAA) dalam rangka perbaikan kereta api relasi Bandara Soetta-Manggarai tersebut.
Sempat terjadi penumpukan penumpang di sejumlah stasiun akibat perbaikan kereta bandara tersebut.