Biaya pendaftaran SM-ITB tahun 2023 sebesar Rp500.000 per pendaftar. Biaya ini sudah termasuk biaya pelaksanaan Ujian Seleksi dan Tes Kemampuan Seni Rupa, dengan ketentuan masing-masing calon mahasiswa paling banyak memilih 3 fakultas/sekolah/program studi pada SM-ITB.
Calon peserta SM-ITB yang memiliki Kartu Indonesia Pintar Kuliah (KIP-K) serta berasal dari SMA/MA di wilayah 3T (terdepan, terpencil, tertinggal) dibebaskan dari biaya pendaftaran SM-ITB dan biaya pendidikan di ITB.
Bila diterima di ITB, mahasiswa dari jalur seleksi mandiri ITB bertanggung jawab membiayai secara penuh pendidikan program sarjananya di ITB, dengan skema pembiayaan mandiri dan tidak mendapatkan subsidi biaya pendidikan. Biaya pendidikan atau Uang Kuliah Tunggal (UKT) per semester bagi mahasiswa sesuai dengan nilai UKT 5, yaitu sebesar Rp12,5 juta dan Rp25 juta, tergantung fakultas/sekolah/prodi.
Mahasiswa jalur seleksi mandiri ITB juga membayar Iuran Pengembangan Institusi (IPI) satu kali selama masa studi, dengan nominal minimum Rp25 juta. Sedangkan untuk Sekolah Bisnis dan Manajemen (SBM), IPI minimum yang ditetapkan sebesar Rp40 juta.