Pratama Arhan memulai karier sepak bola dengan bergabung dengan klub pemuda SSB Putra Mustika. Ia juga sempat bergabung dengan klub pemuda SSB Terang Bangsa dan PSIS Semarang.
Pratama Arhan mulai berkarier bersama dengan tim liga 1 PSIS Semarang pada 1 Januari 2020. Memulai debutnya bersama tim PSIS pada kompetisi Piala Menpora 2021. Setelah sukses bersama PSIS pada 16 Februari 2022 Pratama Arhan diboyong tim profesional Jepang Tokyo Verdy dengan status bebas transfer.
Arhan memiliki nilai plus yaitu full back serba bisa, tak heran jika Tokyo Verdy tertarik dengan Pratama Arhan. Menurut keterangan laman Transfermarkt, pesepakbola berusia 20 tahun itu memiliki nilai pasaran dengan harga 325 ribu euro atau setara Rp5,26 miliar.
Pratama Arhan menjadi kebanggaan dikarenakan pada kompetisi Piala Menpora 2021, ia mendapatkan penghargaan sebagai pemain termuda terbaik. Selain itu, Pratama Arhan bersama dengan Timnas Indonesia berhasil meraih posisi runner up Piala AFF 2020.