Kantor SAR Surabaya telah mengerahkan armada KN SAR 249 Permadi menuju titik koordinat kejadian. Selain itu, Pos SAR Sumenep juga menerjunkan armada cepat Rigid Inflatable Boat (RIB) 01 dari Pelabuhan Kalianget guna mempercepat proses penyelamatan.
Hingga Minggu siang, operasi SAR masih terus berlangsung secara intensif. Berdasarkan komunikasi radio terakhir di lapangan, dilaporkan masih ada sekitar 40 orang penumpang dan kru yang bertahan di atas KMP Mutiara Santosa 2 menunggu giliran untuk dievakuasi.