Dalam uji klinis, peneliti dapat memilih orang-orang yang memiliki karakteristik yang sama, termasuk usia, gaya hidup, dan kebiasaan makan, dan kemudian mengamati mereka berolahraga di waktu yang berbeda.
Ross Andersen, seorang profesor fisiologi olahraga, kedokteran, dan nutrisi di McGill University, juga berpendapat bahwa sulit untuk menentukan apakah manfaat yang diamati dari olahraga pagi disebabkan oleh waktu olahraga atau oleh faktor-faktor lain.
Dia mengatakan bahwa orang-orang yang berolahraga di pagi hari mungkin juga memiliki kebiasaan sehat lainnya, seperti makan makanan yang sehat dan tidur yang cukup, yang berkontribusi pada penurunan berat badan dan kesehatan yang lebih baik.
Menurut Cameron Mitchell, asisten profesor kinesiologi di University of British Columbia, setiap sel tubuh, khususnya sel otot, memiliki jam biologis yang mengatur fungsi tubuh, termasuk metabolisme lemak.
Jam biologis ini bekerja berbeda pada waktu yang berbeda dalam sehari. Olahraga dapat membantu mengatur ulang jam biologis tubuh agar kembali ke ritme normal.