Kusama meninggal dunia di sebuah rumah sakit di Tokyo pada 14 Agustus 2026 dalam usia 97 tahun. Kabar tersebut baru diumumkan kepada publik pada Kamis (27/8/2026).
Tidak ada keterangan mengenai penyebab kematiannya dalam pengumuman tersebut. Yang menjadi catatan terakhir dari perjalanan hidupnya adalah dedikasinya terhadap seni. Kusama disebut masih terus melukis hingga hari-hari terakhir kehidupannya.
Selama hidupnya, ia telah melewati berbagai fase, dari seorang anak yang mengalami halusinasi, seniman muda yang berjuang di Jepang, perempuan Jepang yang mencoba menaklukkan New York, figur avant-garde yang sempat kurang dihargai, hingga akhirnya menjadi salah satu nama paling terkenal dalam seni kontemporer dunia.