Jon merugikan menimbulkan kerugian bagi negara sebesar Rp616.072.728 sesuai laporan hasil perhitungan kerugian keuangan negara dari Badan Pengawasan Keuangan dan Pembangunan (BPKP) perwakilan Maluku tanggal 13 Agustus 2010.
"Sebelumnya melarikan diri sejak tahun 2012 usai pihak jaksa eksekutor melakukan pemanggilan secara patut dan layak berdasarkan ketentuan," ucapnya.
Berdasarkan Putusan Mahkamah Agung (MA) Nomor: 2122 K/PID.SUS/2011 tanggal 12 Februari 2012 terpidana Jon dijatuhi pidana penjara selama empat tahun dan dihukum membayar denda sebesar Rp300 juta subsider enam bulan kurungan.