Usai keduanya memberikan pernyataan siap maju dalam putaran kedua. Panitia muktamar kembali melakukan voting setelah musyarawarah dengan Rais Aam PBNU KH Miftachul Akhyar.
Sementara hasil putaran kedua, Gus Yahya memperoleh 337 suara dan Kiai Said Aqil mendapatkan 210 suara. Atas hasil tersebut, Gus Yahya terpilih sebagai Ketua Umum PBNU periode 2021-2026.
Usai menang, Gus Yahya memeluk dan mencium tangan Kiai Said Aqil. Keduanya duduk bersama dan menerima hasil voting muktamar.
Gus Yahya mengucapkan terima kasih kepada Said Aqil karena baginya Kiai Said merupakan guru yang telah banyak memberikan pengalaman.
"Paling awal saya haturkan terima kasih kepada guru saya, yang mendidik saya, menggembleng dan menguji saya tetapi juga membuka jalan untuk saya dan membesarkan saya yaitu prof dr KH Said Aqil Siradj," tutur Gus Yahya Jumat (24/12/2021).