Berikut daftar lolasi dan cakupan wilayah ke-12 laboratorium tersebut:
1. Balai Besar Laboratorium Kesehatan Jakarta. Balai besar ini memiliki wilayah kerja di Maluku, Maluku Utara, Sumatera Barat, Sumatera Utara dan Aceh.
2. Balai Besar Laboratorium Kesehatan Palembang. Balai besar ini memiliki wilayah kerja di Bengkulu, Bangka Belitung, Sumatera Selatan, Jambi dan Lampung.
3. Balai Besar Laboratorium Kesehatan Makassar. Balai besar ini memiliki wilayah kerja di Gorontalo, Sulawesi Utara, Sulawesi Barat, Sulawesi Tengah, Sulawesi Selatan dan Sulawesi Tenggara.
4. Balai Besar Laboratorium Kesehatan Surabaya. Balai besar ini memiliki wilayah kerja di Kalimantan Selatan, Kalimantan Utara, Kalimantan Tengah, dan Kalimantan Timur.
5. Balai Pengembangan Kesehatan dan Penelitian Papua. Balai besar ini memiliki wilayah kerja di Papua dan Papua Barat.