Proses budidaya beras organik dilakukan dengan menggunakan pupuk organik, seperti kompos, pupuk hijau maupun pupuk hayati Proses organik dapat memperbaiki struktur dan kesuburan tanah, serta membangun ekosistem yang berkelanjutan. Proses organik juga dapat mengendalikan organisme pengganggu tanaman (OPT).
Jika dibandingkan dengan beras non organik, beras organik memiliki beberapa keunggulan di antaranya, saat dimasak, beras organik terasa lebih pulen, beras ini diproses tanpa bahan pengawet sehingga aman untuk dikonsumsi, mendukung kesehatan yang lebih baik karena beras organik yang sehat dan lebih bernutrisi hampir dikonsumsi setiap hari sebagai makanan pokok.
Kemudian, nasi yang lebih awet karena tidak mudah basi atau berlendir bahkan tahan hingga 24 jam, volume lebih banyak dibandingkan dengan beras non organik.
Secara tidak langsung mendukung petani lokal untuk menerapkan pertanian organik yang lebih ramah lingkungan dan memberikan keuntungan lebih besar bagi petani.
Adapun manfaat mengkonsumsi beras organik akan mengurangi kadar urea dalam darah yang selama ini telah menumpuk karena kebiasaan mengkonsumsi beras yang dipupuk dengan urea.