Setelah kematian Clotilde de Vaux, Comte menghabiskan waktu untuk menyusun karya lain yang berjudul "Sistem politik positif" yang menyelesaikan formulasi sosiologinya. Ia mengedepankan moralitas dan kemajuan moral sebagai fokus utama pengetahuan manusia dan pemerintahan. Karyanya mendapatkan pengakuan luas di Eropa dan memengaruhi banyak intelektual.
Comte meninggal karena kanker pada tanggal 5 september tahun 1857, ia meninggal di umur 59 tahun. Meskipun pribadinya agak muram dan egois, ia mengimbanginya dengan semangatnya untuk memajukan kesejahteraan umat manusia dan dedikasi terhadap ide-idenya. Karya-karyanya meskipun berat dan monoton dalam gaya tulisannya namun juga terkenal karena ruang lingkupnya yang besar dan pentingnya dalam pengembangan ilmu sosial modern.
Pada masa setelah Revolusi Perancis, masyarakat sedang mencari tatanan sosial baru yang stabil setelah masa konflik. Comte mengembangkan pemikiran positivisme, yang menjelaskan metode ilmiah sebagai dasar pengetahuan manusia. Ia juga memperkenalkan konsep hukum tiga tahap perkembangan intelektual manusia, dari tahap teologi hingga positif.
Comte mengambil inspirasi dari berbagai filsuf abad ke 18 dan 19 seperti David Hume, Immanuel Kant, dan Saint-Simon. Ia menganggap ilmu pengetahuan modern sebagai kunci untuk memahami dan memperbaiki masyarakat. Klasifikasi ilmu-ilmu yang ia usulkan mulai dari matematika hingga sosiologi, dengan sosiologi dianggap sebagai ilmu yang paling kompleks.
Dalam pemikirannya tentang sosiologi, Comte membaginya menjadi statica sosial (mengenai kekuatan yang menyatukan masyarakat) dan dinamika sosial (mengenai penyebab perubahan sosial). Ia juga memimpikan masyarakat Postifis Ideal yang dipengaruhi oleh struktur gereja Katolik Roma, meskipun dengan agama yang bersifat sekuler.