7. BJ Habibie (11 Maret 1998-21 Mei 1998).
Selama tiga dekade (1978-1998) dipercaya Soeharto sebagai menteri negara riset dan teknologi. BJ Habibie selanjutnya dipercaya sebagai wapres pada 11 Maret 1998. Dia kemudian dilantik sebagai presiden setelah Soeharto mundur.
8. Megawati Soekarnoputri (21 Oktober 1999 -23 Juli 2001).
Ketika Gus Dur naik takhta sebagai Presiden ke-4 RI, Megawati yang merupakan ketua umum PDIP, partai pemenang Pemilu 1999 didapuk sebagai wapres. Saat Gus Dur dilengserkan MPR, Mega menggantikan sebagai Presiden ke-5 RI.
9. Hamzah Haz (26 Juli 2001-20 Oktober 2004)
Ketua Umum Partai Persatuan Pembangunan (PPP) 1998–2007 ini menjadi wapres ke-9 RI, mendampingi Presiden Megawati Soekarnoputri.
10. Jusuf Kalla (20 Oktober 2004-20 Oktober 2009).
Bersama SBY, Jusuf Kalla (JK) memenangi Pilpres 2004. Ini pemilihan presiden-wakil presiden pertama yang dilakukan secara langsung. Sebelum menjabat wapres, JK juga pernah menjabat menteri di era Presiden Gus Dur dan Megawati Soekarnoputri.
11. Boediono (20 Oktber 2009-20 Oktober 2014).
Mantan Gubernur BI ini digandeng SBY untuk menjadi cawapres dalam Pilpres 2009. Duet ini memenangi pemilu dan dilantik pada 20 Oktober 2009.
12. Jusuf Kalla (20 Oktober 2014-20 Oktober 2019).
Berpasangan dengan Jokowi maju di Pilpres 2014. Jokowi-JK memenangi pemilu atas rivalnya, Prabowo Subianto-Hatta Rajasa. Ini jabatan wapres kedua yang pernah diemban JK.
13. Ma’ruf Amin (20 Oktober 2019- 2019-2024).
Secara mengejutkan dipasangkan dengan Jokowi untuk maju di Pilpres 2019 menghadapi Prabowo Subianto-Sandiaga Uno. Sebelum menjabat wapres, Ma’ruf Amin dikenal sebagai Ketua Umum MUI dan Rais Aam PBNU.